Již od roku 1972 je Filharmonie Bohuslava Martinů pořadatelem ojedinělého mezinárodního festivalu mladých koncertních umělců Talentinum a od roku 1999 organizuje podzimní mezinárodní hudební festival Harmonia Moraviae.
Myšlenka na založení symfonického orchestru vznikla ve Zlíně již ve dvacátých letech minulého století. První koncertní vystoupení orchestru se datuje na 30. dubna 1946. V květnu 1950 zahájila Filharmonie pracujících svou první lázeňskou sezonu v Luhačovicích. Pět letních měsíců produkcí pro lázeňské hosty se stalo v dalších letech tradicí.
Postupně z něj vyrostl významný český orchestr, jehož umělecký profil utvářela řada vynikajících šéfdirigentů a stálých či hostujících dirigentů. S orchestrem vystoupila řada vynikajících světových sólistů. Na koncertě k 70. výročí založení filharmonie, 28. 4. 2016, zahrál klavírista Fazil Say.
Do repertoáru filharmonie patří velká symfonická díla, ale též skladby přesahující i do oblasti jazzu, šansonu nebo populární hudby, proto zve ke spolupráci umělce a soubory nejen tzv. vážné hudby, ale i dalších hudebních žánrů. Hostuje též ve všech významnějších centrech České republiky a zahraničí. V roce 2016 vystoupila Filharmonie Bohuslava Martinů jako první český orchestr po 57 letech v Indii.